Además recorre Europa, visitando Bélgica, Inglaterra y Holanda, donde hay muchos españoles emigrados por razones políticas, y como la mayoría de ellos vuelve a la patria a la muerte del tirano. Su compromiso político va en aumento y su actividad matemática en disminución: hay tareas más urgentes. Entra en el gobierno como Director General de Estudios en 1835 y vuelve a ser elegido diputado por Granada en 1836 al mismo tiempo que escribe y hace campaña en pro de urgentes reformas sobre diversos asuntos. La necesidad de la canalización de agua corriente a/en las ciudades, informes sobre la nueva división territorial administrativa —que pasa con los liberales del sistema de diócesis eclesiásticas al de provincias—, ferrocarriles, sistema métrico decimal y nuevas versiones de sus libros para la enseñanza. A partir de 1843 es senador vitalicio.

La vida de Vallejo, contrastada con su obra, es el mejor reflejo de la continua contradicción en la que se desarrolla la vida de los científicos españoles en este atormentado trozo de la historia de España. Prometedor estudioso e investigador de las matemáticas que en los primeros años del XIX tiene preparados para difundir en castellano los rasgos más modernos del paradigma lagrangiano, complementando los meritorios Elementos de Matemáticas de Bails, cuando la política le abre los ojos a problemas más perentorios que el estudio de la curvatura de líneas. Cuestiones de agricultura, máquinas, aguas, regulación de las pesas y medidas, ferrocarriles y en todo momento la obsesión por la educación de los niños.


Obras: Aritmética para niños (Madrid, 1804), Adiciones a la Geometría de don Benito Bails (Madrid, 1806), Memoria sobre la curvatura de las líneas (Madrid,1807), Máximas militares y políticas (Madrid, 1808), Tratado completo del arte militar (Palma, 1812), Tratado elemental de Matemáticas (3 tomos en cinco volúmenes, los dos primeros editados en Palma, el tercero en Valencia, 1812-1817), Disertación sobre el modo de perfeccionar la agricultura (Madrid, 1815), Compendio de mecánica práctica (Madrid, 1815), Compendio de Matemáticaspuras y mixtas (Valencia, 1819), Teoría de la lectura (Madrid, 1825), Modo de poner en ejecución el nuevo método de enseñar a leer (París, 1826), Ideas primarias que deben darse a los niños ... acerca de los números (París,1826), Nueva cartilla (París, 1826), Método de enseñar a escribir (París, 1827), Tratado sobre el movimiento y aplicaciones de las aguas (Madrid, 1833), Instrucción ... para enseñar a leer ... (Madrid, 1834), Nociones geográficas y astronómicas para comprender la nueva división del territorio español (Madrid, 1834), Definiciones y extractos de las principales reglas y operaciones de la Aritmética (Madrid, 1840), Explicación del sistema decimal (Madrid, 1840), Nociones generales de Ideología y Gramática española (Madrid, 1842), Nueva construcción de caminos de fierro (Madrid, 1844), Programa llamando licitadores a la empresa de traída de aguas a Madrid (Madrid, 1845). Póstumamente aparecieron un Tratado completo de Matemáticas y un Algebra (París, 1856).